Курсы в университете не обязательны. Стоит только осознавать, что для того, чтобы  у вас все получилось, вам для начала нужно пройти процедуру признания равноценности вашего образования, как бакалавра (то есть нострификации, существует же не только признание равноценности среднего образования, но и высшего). Это происходит в Чехии, и не столь важно, какая специальность, будь то строительная, или же медицинская, бумажная волокита длится около  полутора месяцев, а вот само признание может совсем не потребовать вашего участия — это в случае, если ваши предметы, и предметы чешского университета, совпадают, а вот если вам чего-то не хватит, то вам наверняка назначат сдавать экзамен по недостающим предметам (или по предметам, по которым глобальная разница в часах), разумеется, если вы хотите учиться на чешском языке, то и процедура признания будет идти на чешском, в виде экзаменов (устные, письменные, прикладные, зависит от вашей специальности и экзаменов). С медицинскими специальностями, конечно, дела обычно обстоят немного сложнее, но все в принципе реально. Благо, если в Европу человек приезжает не на образование, а например лечение, то таких заморочек со «старым» образованием нет, например лечение в клиниках Швейцарии доступно многим, прочитайте подробнее на страницах сайта http://www.alerce.ru/.

Я лично никогда не сталкивался с признанием равноценности бакалавра, хотя люди это делают, все реально, просто не смогу вам рассказать никаких тонкостей, простите. А вот, что полезно еще знать, но это совсем не тонкость — где вы выучили чешский язык, всем все равно, так что не стоит бояться, что вас не примут в магистратуру в Чехии, по причине, что язык вы выучили на Родине, это правда не важно — главное одно, как вы знаете язык, а не место, где вы его учили. Сертификат, подтверждающий знание, требуется очень редко, главное знайте, язык на уровне не хуже общепринятых стандартов B2, но если сертификат понадобится, то Карлов Университет за цену примерно в 4 тысячи чешских крон, проводит экзамены для любого, кто захочет, выдав свой сертификат, конечно, если человек сдает успешно экзамен. Но, я почти уверен, что сертификат — бумажка,  никому не потребуется, мне лично он никогда в жизни не требовался.